新聞網(wǎng)訊 近日,,青島醫(yī)學(xué)院任賀教授團(tuán)隊(duì)與中科院青島生物能源與過程研究所單細(xì)胞中心徐健教授團(tuán)隊(duì)合作,在方法學(xué)雜志《Small Methods》(IF=10.7)上發(fā)表題為“Label-Free Prediction of Tumor Metastatic Potential via Ramanome”的研究成果,。青島醫(yī)學(xué)院博士后張宇星,、中科院青島生物能源與工程研究所張艷美博士和青島醫(yī)學(xué)院鞏芮寧博士為共同第一作者,青島醫(yī)學(xué)院任賀教授,、中科院青島生物能源與工程研究所徐健教授,、鄭曉?shī)櫢呒?jí)工程師為共同通訊作者,該研究得到國(guó)家杰出青年科學(xué)基金,、國(guó)家自然科學(xué)基金,、山東省泰山學(xué)者計(jì)劃、山東省自然科學(xué)基金重大基礎(chǔ)研究項(xiàng)目,、山東省博士后創(chuàng)新人才計(jì)劃,、山東能源研究院項(xiàng)目等多項(xiàng)資金的大力支持。
本研究利用單細(xì)胞拉曼光譜免標(biāo)記,、非破壞性,、代謝信息豐富、快速,、低成本等特色,,結(jié)合機(jī)器學(xué)習(xí)算法推出一種全新的腫瘤轉(zhuǎn)移潛力評(píng)估工具——拉曼組指導(dǎo)的腫瘤轉(zhuǎn)移指數(shù)(Ramanome-based metastasis index,RMI),實(shí)現(xiàn)了對(duì)不同腫瘤類型的細(xì)胞體內(nèi)和體外轉(zhuǎn)移能力的高效評(píng)估,。該方法克服了生物學(xué)實(shí)驗(yàn)手段耗時(shí),、費(fèi)力,同時(shí)還受樣本限制和操作人員技術(shù)熟練度影響等缺點(diǎn),,用更為客觀,、穩(wěn)定、操作簡(jiǎn)便的物理學(xué)方法替代傳統(tǒng)的生物學(xué)方法對(duì)腫瘤轉(zhuǎn)移能力進(jìn)行精準(zhǔn)預(yù)測(cè),,為腫瘤轉(zhuǎn)移和相關(guān)轉(zhuǎn)移機(jī)制研究提供了全新解決方案,。
研究團(tuán)隊(duì)還發(fā)現(xiàn),脂質(zhì)相關(guān)的拉曼峰在RMI計(jì)算中的作用尤為顯著,。通過脂質(zhì)組學(xué)定量分析,,團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步揭示了腫瘤細(xì)胞的轉(zhuǎn)移能力與多種膜結(jié)構(gòu)及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)脂質(zhì)(如磷脂酰膽堿、磷脂酰乙醇胺,、膽固醇酯,、神經(jīng)酰胺、雙(單?;视停┝姿猁}等)之間的顯著相關(guān)性,,同時(shí)也與脂質(zhì)特定的不飽和度有一定的相關(guān)性。因此,,RMI不但可以準(zhǔn)確的評(píng)估和預(yù)測(cè)腫瘤的轉(zhuǎn)移能力,,還可以為腫瘤轉(zhuǎn)移機(jī)制的深入研究提供重要分子依據(jù)。未來(lái),,RMI有望在腫瘤診斷,、個(gè)性化治療方案制定等領(lǐng)域發(fā)揮重要作用,為癌癥患者的早期干預(yù)和治療提供新的技術(shù)支撐,。
原文鏈接:https://doi.org/10.1002/smtd.202400861