新聞網(wǎng)訊 近期,,我校公共衛(wèi)生學(xué)院于典科教授團(tuán)隊(duì)基于系統(tǒng)毒理學(xué)研究思路,,整合典型肝損傷物質(zhì)的臨床病例,、生化指標(biāo)、動(dòng)物組學(xué),、分子通路等多維數(shù)據(jù),,借助數(shù)學(xué)模型和計(jì)算機(jī)模型,成功構(gòu)建了基于機(jī)制的肝損傷預(yù)測(cè)模型,,并對(duì)模型進(jìn)行了驗(yàn)證和優(yōu)化,。相關(guān)研究成果以“An entropy weight method to integrate big omics and mechanistically evaluate drug-induced liver injury”為題發(fā)表在肝病學(xué)頂級(jí)期刊Hepatology上(DOI:10.1097/HEP.0000000000000628)。于典科為本文通訊作者,,公共衛(wèi)生學(xué)院青年教師靳遠(yuǎn)和碩士研究生首瑩清為本文共同第一作者,。
作為化學(xué)性肝損傷中最具代表性的一種,藥物誘導(dǎo)的肝損傷(Drug-induced Liver Injury, DILI)雖然發(fā)生率不高,,但一直是公眾健康面臨的巨大挑戰(zhàn),,也是制藥行業(yè)臨床和臨床前藥物開(kāi)發(fā)失敗的主要原因之一。在臨床前毒理學(xué)研究領(lǐng)域,,藥物安全數(shù)據(jù)長(zhǎng)期以來(lái)一直依賴于藥物作用報(bào)告和動(dòng)物測(cè)試模型,,這些數(shù)據(jù)或難以提供機(jī)制信息,,或缺少人類相關(guān)性。隨著機(jī)制毒理學(xué)日漸重要的作用,,DILI的發(fā)生機(jī)制是一個(gè)亟待解決的研究空白,。
該研究首先將典型肝損傷物質(zhì)的組學(xué)信息進(jìn)行整合,提煉11條共性通路,,系統(tǒng)概括DILI發(fā)生時(shí)的各種細(xì)胞應(yīng)答(包括毒性反應(yīng)和適應(yīng)性反應(yīng)),,構(gòu)建了DILI預(yù)測(cè)模型。接下來(lái),,利用熵值法這一數(shù)學(xué)模型將差異基因賦權(quán),,表征某一通路內(nèi)各基因差異表達(dá)對(duì)該通路整體擾動(dòng)的貢獻(xiàn);并利用可解釋的機(jī)器學(xué)習(xí)模型將通路賦權(quán),,表征多條通路擾動(dòng)對(duì)損傷發(fā)生的貢獻(xiàn),,從而從整體上更準(zhǔn)確地表征DILI結(jié)局。最后,,將構(gòu)建好的模型用于89個(gè)藥物樣品點(diǎn)(61個(gè)陽(yáng)性+ 28個(gè)陰性)的預(yù)測(cè),。基于“對(duì)毒性機(jī)制越了解,、對(duì)毒性預(yù)測(cè)越準(zhǔn)確”的理念,,模型可達(dá)到86%或更高的精確度。
該研究整合毒理學(xué)大數(shù)據(jù),,結(jié)合數(shù)學(xué)和計(jì)算機(jī)模型,,將毒性通路量化,使其可以同步表征生化指標(biāo)(如血清ALT的上升),,實(shí)現(xiàn)了“不依賴動(dòng)物終點(diǎn)效應(yīng)”的藥物肝損傷預(yù)測(cè),,可以為臨床前藥物開(kāi)發(fā)、機(jī)制毒理學(xué),、數(shù)據(jù)整合模型開(kāi)發(fā)等多個(gè)領(lǐng)域提供科學(xué)依據(jù),。
原文鏈接:An entropy weight method to integrate big omics and mechanistically evaluate drug-induced liver injury - PubMed (nih.gov)